El desarrollador principal de Assassin's Creed Shadows asegura a los jugadores que centrarse en un solo protagonista no afectará significativamente su experiencia general. El juego presenta dos personajes jugables: Naoe, una femenina Shinobi, y Yasuke, un samurai africano histórico, cuya inclusión ha generado una discusión previa a la liberación.
Surgieron preocupaciones de que priorizar a un personaje podría conducir a elementos de la historia perdidos o un juego. El director creativo Jonathan Dumont abordó estas preocupaciones, describiendo su propio enfoque equilibrado: generalmente juega 3-5 horas con un personaje, luego cambia al otro durante 2-3 horas.
Sin embargo, Dumont aclaró que los jugadores no estarán en desventaja sustancial al favorecer a un personaje. Si bien cada protagonista cuenta con secuencias de apertura únicas y historias personales, la narrativa del juego se adapta a la elección del jugador. Él alienta a los jugadores a seguir sus preferencias: "La experiencia central es flexible. Elija su favorito; la narración se ajustará". Esencialmente, mientras existen arcos de personajes individuales, la historia principal sigue siendo accesible, independientemente de qué personajes utilizan principalmente los jugadores.
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